More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6710 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6710  Beta-glucosidase  100 
 
 
671 aa  1379    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.593883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0107  beta-glucosidase protein  54.39 
 
 
656 aa  705    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0734039  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4300  Beta-glucosidase  54.79 
 
 
669 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0170448  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3307  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.1 
 
 
659 aa  718    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2446  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.77 
 
 
659 aa  683    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.802964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2541  glycoside hydrolase family 3 domain protein  55.86 
 
 
658 aa  682    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1719  glycoside hydrolase family protein  48.83 
 
 
640 aa  582  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2741  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.17 
 
 
670 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2344  Xylan 1,4-beta-xylosidase  43.18 
 
 
608 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04360  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.59 
 
 
618 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.117639 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01804  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  41.34 
 
 
618 aa  451  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.497793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3149  Beta-glucosidase  41.97 
 
 
663 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  42.39 
 
 
609 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3250  glycoside hydrolase family 3 protein  39.93 
 
 
588 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2687  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.91 
 
 
677 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  0.221922 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3059  xylan 1,4-beta-xylosidase  32.11 
 
 
754 aa  352  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1258  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.3 
 
 
779 aa  350  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.539798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0139  glycoside hydrolase family 3 protein  32.98 
 
 
753 aa  347  5e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000855243  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1591  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.34 
 
 
705 aa  286  8e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.241667  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07120  beta-glucosidase  34.46 
 
 
478 aa  267  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0471  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.14 
 
 
797 aa  258  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20270  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.03 
 
 
675 aa  249  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02260  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.94 
 
 
804 aa  240  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.32 
 
 
762 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.83 
 
 
778 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.26 
 
 
778 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.2 
 
 
790 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.15 
 
 
782 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.88 
 
 
807 aa  163  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  26.11 
 
 
808 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2600  glycoside hydrolase family 3 protein  26.67 
 
 
1271 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0793818  decreased coverage  0.00832929 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1250  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.86 
 
 
644 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0078  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.89 
 
 
702 aa  161  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2444  glycoside hydrolase family 3 protein  27.04 
 
 
1271 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.592108  normal  0.597577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3577  b-glucosidase  26.69 
 
 
750 aa  158  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2616  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.81 
 
 
615 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2365  xylosidase/arabinosidase  27.04 
 
 
759 aa  158  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.327511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  26.17 
 
 
618 aa  158  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  30.64 
 
 
805 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.28 
 
 
736 aa  154  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  25.42 
 
 
1581 aa  154  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  29.82 
 
 
758 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.48 
 
 
762 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1370  Beta-glucosidase  30.68 
 
 
737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  25.26 
 
 
743 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  25.93 
 
 
766 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  29.98 
 
 
886 aa  147  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1564  glycoside hydrolase family 3 protein  28.44 
 
 
755 aa  147  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.68 
 
 
902 aa  146  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  30.13 
 
 
859 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.04 
 
 
792 aa  145  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.77 
 
 
1564 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0249  glycoside hydrolase family 3 protein  25.99 
 
 
750 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.92 
 
 
756 aa  143  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  28.51 
 
 
739 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5561  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  26.96 
 
 
612 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3463  glycoside hydrolase family 3 protein  27.69 
 
 
721 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  27.71 
 
 
787 aa  140  4.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  29.11 
 
 
765 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5444  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.47 
 
 
828 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.615677  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.42 
 
 
777 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1132  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.77 
 
 
752 aa  137  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.730093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3192  glycoside hydrolase family 3 protein  30.75 
 
 
811 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.97 
 
 
751 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2273  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  25.9 
 
 
820 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.02 
 
 
783 aa  134  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.57 
 
 
795 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0530  glycoside hydrolase family protein  25.23 
 
 
751 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  28.67 
 
 
772 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.19 
 
 
769 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.22 
 
 
784 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3739  periplasmic beta-glucosidase  25.17 
 
 
740 aa  130  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22686  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.35 
 
 
760 aa  130  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.71 
 
 
771 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3577  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.78 
 
 
723 aa  130  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.622283  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1689  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.57 
 
 
619 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0593  glycoside hydrolase family 3 protein  26.66 
 
 
727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1047  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.05 
 
 
733 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0532  putative periplasmic beta-glucosidase  25.93 
 
 
727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 
772 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.47 
 
 
760 aa  129  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.31 
 
 
799 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  27.61 
 
 
966 aa  129  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.03 
 
 
754 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  30.22 
 
 
789 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  27.23 
 
 
802 aa  127  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.78 
 
 
801 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3248  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.74 
 
 
769 aa  127  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00760548  normal  0.0240048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.82 
 
 
766 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  24.7 
 
 
745 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3263  Beta-glucosidase  27.8 
 
 
678 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.61 
 
 
804 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.21 
 
 
757 aa  126  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5523  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.29 
 
 
714 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.57 
 
 
773 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0397  Beta-glucosidase-related glycosidase  25.66 
 
 
760 aa  125  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000776871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3972  glycoside hydrolase family 3 protein  25.3 
 
 
763 aa  124  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471941  normal  0.534128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  28.42 
 
 
631 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  26.92 
 
 
763 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  31.69 
 
 
764 aa  124  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>