27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0123 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  100 
 
 		 944 aa  1914    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  58.74 
 
 		 954 aa  1098    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  43.9 
 
 		 1322 aa  104  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  45.69 
 
 		 1422 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  44.83 
 
 		 1427 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.99 
 
 		 834 aa  97.8  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  45.92 
 
 		 861 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  44.79 
 
 		 475 aa  85.9  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  36.07 
 
 		 1426 aa  85.1  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  35.83 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  37.6 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  39.58 
 
 		 690 aa  67.8  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  32.28 
 
 		 6678 aa  67.8  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  32.87 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0570  putative lipoprotein  29.07 
 
 		 338 aa  60.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  29.21 
 
 		 718 aa  60.1  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1084  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.66 
 
 		 675 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00047148  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0121  hypothetical protein  28.1 
 
 		 362 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0013  F5/8 type C domain protein  33.12 
 
 		 663 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.538854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  55.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  26.07 
 
 		 1028 aa  54.7  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  35.14 
 
 		 506 aa  52  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.78 
 
 		 1448 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  24.35 
 
 		 768 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2555  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.15 
 
 		 736 aa  49.7  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1086  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.63 
 
 		 665 aa  46.2  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.79 
 
 		 674 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>