19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2651 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  100 
 
 		 506 aa  1002    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  56.97 
 
 		 718 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  37.93 
 
 		 1426 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  41.67 
 
 		 1322 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  41.41 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  34.11 
 
 		 1427 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  37.04 
 
 		 1422 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.09 
 
 		 834 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  37.36 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  32.35 
 
 		 861 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  37.5 
 
 		 690 aa  60.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  39.18 
 
 		 1053 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  34.02 
 
 		 954 aa  54.3  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  30.95 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  35.14 
 
 		 944 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  36.99 
 
 		 206 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  38.75 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  35.87 
 
 		 1124 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1084  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.74 
 
 		 675 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00047148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>