22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1786 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  972    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  41.55 
 
 		 206 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  46.43 
 
 		 861 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  39.61 
 
 		 1322 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  47.01 
 
 		 1422 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  45.3 
 
 		 1427 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  41.55 
 
 		 1426 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  42.52 
 
 		 690 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  44.79 
 
 		 944 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  38.52 
 
 		 954 aa  79  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  40.24 
 
 		 834 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  35.71 
 
 		 540 aa  73.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  33.06 
 
 		 718 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  36.73 
 
 		 487 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  37.36 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1084  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.87 
 
 		 675 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00047148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4938  hypothetical protein  27.32 
 
 		 225 aa  53.9  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2553  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.23 
 
 		 728 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.04 
 
 		 1073 aa  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  32.58 
 
 		 1053 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1018  hypothetical protein  27.33 
 
 		 518 aa  43.5  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2555  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.41 
 
 		 736 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>