21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5834 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  425  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  41.55 
 
 		 475 aa  153  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  41.91 
 
 		 1426 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  40.38 
 
 		 1322 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  39.13 
 
 		 1422 aa  98.6  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  38.89 
 
 		 1427 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  41.6 
 
 		 861 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  33.67 
 
 		 690 aa  91.7  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  37.6 
 
 		 944 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  35.77 
 
 		 954 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.85 
 
 		 834 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  32.37 
 
 		 540 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  37.17 
 
 		 718 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  41.03 
 
 		 487 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22340  alpha-1,2-mannosidase, putative  34.62 
 
 		 1073 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  36.99 
 
 		 506 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.67 
 
 		 6678 aa  49.7  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  31.25 
 
 		 1053 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1084  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.74 
 
 		 675 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00047148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2553  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.41 
 
 		 728 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4938  hypothetical protein  26.72 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>