65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4828 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  100 
 
 
555 aa  1146    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  33.74 
 
 
503 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  33.96 
 
 
794 aa  70.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  33.77 
 
 
566 aa  67.8  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2997  hypothetical protein  27.08 
 
 
390 aa  67  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.929467  hitchhiker  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  34.21 
 
 
582 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2704  hypothetical protein  26.16 
 
 
390 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.732051 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  33.12 
 
 
411 aa  63.9  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.3 
 
 
514 aa  61.6  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.04 
 
 
507 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  26.28 
 
 
230 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  27.64 
 
 
2073 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.56 
 
 
520 aa  59.3  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  40.23 
 
 
436 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  29.12 
 
 
571 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  31.76 
 
 
491 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  34.25 
 
 
412 aa  58.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.61 
 
 
474 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.67 
 
 
507 aa  57.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  32.08 
 
 
537 aa  57.4  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.67 
 
 
507 aa  57.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.17 
 
 
510 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.37 
 
 
507 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.33 
 
 
695 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  36.78 
 
 
497 aa  53.5  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  31.01 
 
 
494 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  30.05 
 
 
425 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  29.59 
 
 
1259 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  30.26 
 
 
430 aa  52.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  32 
 
 
897 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.35 
 
 
756 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  26.32 
 
 
563 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.26 
 
 
472 aa  52  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  28.86 
 
 
618 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.31 
 
 
466 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2260  hypothetical protein  22.11 
 
 
368 aa  51.6  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39109  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  29.61 
 
 
672 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  31.58 
 
 
1413 aa  50.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  29.41 
 
 
560 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  30.21 
 
 
1139 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  29.01 
 
 
806 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  34.07 
 
 
943 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  30 
 
 
474 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  27.41 
 
 
401 aa  47.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  29.9 
 
 
503 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  32.63 
 
 
576 aa  47  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  26.49 
 
 
691 aa  46.6  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0759  hypothetical protein  28.25 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0329253  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  28.48 
 
 
606 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  27.17 
 
 
963 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  27.59 
 
 
445 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  31.43 
 
 
647 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  29.1 
 
 
495 aa  46.2  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  25.62 
 
 
680 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  25.62 
 
 
676 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  25.62 
 
 
676 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  34.44 
 
 
824 aa  45.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  31.43 
 
 
487 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  26.71 
 
 
701 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  26.71 
 
 
701 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  26.71 
 
 
701 aa  44.3  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  31.61 
 
 
576 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  25 
 
 
476 aa  44.3  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  28.38 
 
 
737 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  30.34 
 
 
771 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>