16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3900 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_3900  hypothetical protein  100 
 
 		 731 aa  1468    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.020807  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3906  Ricin B lectin  37.73 
 
 		 744 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0306743  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  37.23 
 
 		 582 aa  203  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3897  Parallel beta-helix repeat protein  37.72 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00247458  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  35.31 
 
 		 563 aa  153  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  35.19 
 
 		 560 aa  147  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1869  parallel beta-helix repeat protein  36.42 
 
 		 384 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08927  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 		 355 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.096319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  31.69 
 
 		 566 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  34.9 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  28.87 
 
 		 411 aa  55.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.9 
 
 		 487 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  31.94 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  25.32 
 
 		 1139 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  27.27 
 
 		 1413 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>