38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2560 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  100 
 
 		 656 aa  1330    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  43.7 
 
 		 1410 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1730  Ig domain protein  39.31 
 
 		 1170 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.07641 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1519  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1513 aa  324  4e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.44444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  30.69 
 
 		 982 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  24.48 
 
 		 544 aa  87  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4280  beta-glycosidase  21.65 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  23.78 
 
 		 726 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  23.82 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  24.48 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3872  hypothetical protein  21.51 
 
 		 538 aa  67.4  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.875392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  22.66 
 
 		 532 aa  67.4  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  26.89 
 
 		 737 aa  64.3  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1600  hypothetical protein  23.72 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2880  hypothetical protein  24.16 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  30.29 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  31.88 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  22.42 
 
 		 681 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  39.47 
 
 		 240 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  37.21 
 
 		 582 aa  51.6  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  31.39 
 
 		 412 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  31.43 
 
 		 537 aa  50.8  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  27.07 
 
 		 664 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.82 
 
 		 503 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  30.28 
 
 		 514 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  29.71 
 
 		 491 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  50.94 
 
 		 436 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.5 
 
 		 510 aa  47.4  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.01 
 
 		 695 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.71 
 
 		 507 aa  47  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  30.72 
 
 		 963 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  42.86 
 
 		 451 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  32.54 
 
 		 663 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.26 
 
 		 507 aa  44.7  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  35.09 
 
 		 569 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3906  Ricin B lectin  37.04 
 
 		 744 aa  44.3  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0306743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  29.59 
 
 		 548 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4070  hypothetical protein  24.62 
 
 		 640 aa  43.9  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>