More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1064 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  798    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
362 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 
367 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
401 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 
374 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 
374 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.84 
 
 
384 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 
374 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
374 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.11 
 
 
376 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
398 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.07 
 
 
404 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
371 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
389 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  29.18 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.19 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
419 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
370 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
369 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.49 
 
 
373 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.64 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
379 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54068  n-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  26.48 
 
 
450 aa  91.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.15052  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 
391 aa  90.5  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
435 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
369 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
374 aa  89.7  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
394 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
613 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.29 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
367 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.34 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  24.55 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.81 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
386 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.81 
 
 
379 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  21.28 
 
 
427 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
378 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
408 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
404 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 
355 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
414 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
377 aa  86.3  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  26.8 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2291  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.69 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  25.49 
 
 
650 aa  84.3  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.56 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
423 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  26.29 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.87 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  23.54 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  26.84 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.15 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.76 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  20.43 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  24.24 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1364  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.44 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
372 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.6 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  24.19 
 
 
403 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.83 
 
 
402 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>