More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0540 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
369 aa  765    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  55.01 
 
 
376 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  52.3 
 
 
381 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  51.22 
 
 
370 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  52.57 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  53.66 
 
 
376 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  52.45 
 
 
404 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  50.95 
 
 
379 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
377 aa  381  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  47.7 
 
 
371 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  44.84 
 
 
370 aa  339  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  41.1 
 
 
377 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
385 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 
362 aa  216  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 
367 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
369 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 
367 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
383 aa  157  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
377 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 
378 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
378 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
382 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
385 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
389 aa  139  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  27.46 
 
 
638 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  29.64 
 
 
376 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
613 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
536 aa  82.8  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 
423 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 
376 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  23.54 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
424 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
426 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  27.54 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
373 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.14 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  25.81 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.73 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  29.2 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  21.28 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
377 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
402 aa  72.8  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  30.84 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
904 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.17 
 
 
380 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.41 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2803  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  26.51 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.68 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  21.96 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 
453 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  36.27 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
366 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  21.5 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  25.91 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>