More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0637 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 383 aa  788    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  32.63 
 
 		 379 aa  219  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  30.81 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 382 aa  186  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 378 aa  169  6e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.42 
 
 		 373 aa  143  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 236 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1323  glycosyltransferase  26.23 
 
 		 370 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.59185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 372 aa  99.8  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 393 aa  92.8  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.23 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 377 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  22.02 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 373 aa  86.3  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 763 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2890  glycosyltransferase-like protein  26.79 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.47 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.72 
 
 		 822 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  22.39 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.39 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  23.8 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0231  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0791  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  25.39 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  23.78 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.7 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.57 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.63 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1517  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1083  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.28 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  24.28 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.75 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  25.07 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  25.64 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1641  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.65 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  23.6 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  30.73 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>