More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1517 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1517  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
408 aa  834    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 
391 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.63 
 
 
427 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  24.63 
 
 
430 aa  90.1  7e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
360 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 
378 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
765 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 
379 aa  86.3  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  33.33 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 
763 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  22.92 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
377 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
376 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 
385 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
366 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  26.26 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
385 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  30.2 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  30.56 
 
 
486 aa  73.9  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.41 
 
 
745 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.74 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
403 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
575 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  26.85 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  29.96 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.9 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.87 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  30 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
398 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 
384 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.63 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  21.07 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.57 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.64 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  23.36 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  32.81 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  29.14 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  29.14 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
410 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
385 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>