More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0613 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0613  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  755    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.529786  normal  0.125987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2479  glycosyl transferase, group 1  39.63 
 
 
379 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0654086  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1719  glycosyl transferase, group 1  37.09 
 
 
382 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.30336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1523  glycosyltransferase  34.04 
 
 
387 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 
385 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
383 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4566  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 
371 aa  179  5.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.416296  normal  0.520192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
391 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0231  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
378 aa  167  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.282789 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3176  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.2 
 
 
373 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2648  glycosyl transferase, group 1  39 
 
 
236 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3273  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1323  glycosyltransferase  25.58 
 
 
370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.59185  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
379 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
389 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
403 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
386 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
380 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
362 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
377 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.18 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 
398 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
377 aa  93.2  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
365 aa  90.5  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
355 aa  86.3  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  21.81 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
382 aa  84  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  28.02 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  24.35 
 
 
1119 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.99 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.74 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.34 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.96 
 
 
427 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  23.96 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  33.03 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  33.88 
 
 
383 aa  80.1  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  20.88 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5390  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.7 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.839931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0846  glycosyltransferase-like protein  29.68 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 
348 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  33.47 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0406  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
359 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0116053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0759  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
394 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
505 aa  76.6  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.34 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.45 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
390 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.06 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  31.64 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
517 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.61 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1365  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  22.61 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  22.61 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.59 
 
 
349 aa  73.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.38 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.61 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>