More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2061 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
418 aa  861    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
421 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 
402 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  26.32 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  26.24 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
407 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  27.76 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  22.65 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 
460 aa  77.4  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 
410 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  22.69 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  24.32 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  23.72 
 
 
385 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  23.16 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
411 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  22.59 
 
 
403 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  29.32 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
389 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02497  glycosyl transferase  30.95 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.45745  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  26.15 
 
 
381 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  34.96 
 
 
382 aa  59.7  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  21.49 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
409 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
406 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 
373 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
371 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  30 
 
 
377 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  30 
 
 
373 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
371 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.33 
 
 
411 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  21.57 
 
 
405 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  29.46 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  27.03 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  20.48 
 
 
402 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  32.26 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1692  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
375 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0818  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
381 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  29.17 
 
 
377 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.24 
 
 
366 aa  54.7  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  29.03 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
358 aa  54.3  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
433 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  33.62 
 
 
374 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
381 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
439 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  25.35 
 
 
382 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
748 aa  53.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.9 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  30.61 
 
 
188 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  29.17 
 
 
377 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.35 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
398 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  32.5 
 
 
557 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
409 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5371  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
352 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
370 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  36.19 
 
 
346 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 
384 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  25.7 
 
 
363 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
379 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
413 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  30.83 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.45 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
810 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.45 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  25.15 
 
 
377 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  34.15 
 
 
353 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
401 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.67 
 
 
407 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
398 aa  50.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>