More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0109 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  100 
 
 		 401 aa  830    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  38.81 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  38.08 
 
 		 443 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  39.35 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 		 413 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  36.97 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  36.82 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  37.84 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  37.34 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  35.73 
 
 		 455 aa  247  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 406 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  36.06 
 
 		 402 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  35.47 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  36.88 
 
 		 412 aa  243  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 408 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 		 409 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 		 453 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 428 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 402 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  35.48 
 
 		 415 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  35.31 
 
 		 432 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  33.84 
 
 		 417 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 		 423 aa  209  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  32.01 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  36.67 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  32.76 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  31.04 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 518 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  30.38 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  25.28 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 406 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  45.54 
 
 		 188 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  45.54 
 
 		 188 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.41 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.59 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  32.08 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  26.94 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.59 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.26 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 660 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.42 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.77 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  25.68 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.47 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  24.38 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  25.89 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  27.21 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 		 770 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.6 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.6 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  27.92 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.6 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  22.64 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  26.47 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  26.42 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>