More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2591 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
410 aa  848    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  68.86 
 
 
412 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  60.68 
 
 
407 aa  535  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  56.72 
 
 
407 aa  507  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  60.32 
 
 
369 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  55.76 
 
 
420 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  51.7 
 
 
413 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  52.91 
 
 
443 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  51.21 
 
 
413 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  50 
 
 
407 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  48.66 
 
 
415 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  47.32 
 
 
428 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  45.23 
 
 
406 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  47.28 
 
 
518 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  45.93 
 
 
402 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  50 
 
 
407 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  46.27 
 
 
455 aa  364  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  45.79 
 
 
453 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  48.06 
 
 
407 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  48.43 
 
 
409 aa  349  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  43.86 
 
 
408 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  45.24 
 
 
405 aa  342  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  45.17 
 
 
411 aa  339  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  42.32 
 
 
402 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  41.89 
 
 
432 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  45.09 
 
 
385 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 
423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  39.51 
 
 
405 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  40.5 
 
 
406 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  40.81 
 
 
460 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  39.71 
 
 
417 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  40.09 
 
 
437 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  40.42 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  39.18 
 
 
415 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
406 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 
412 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  37.97 
 
 
401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
412 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  35.66 
 
 
401 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
390 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  27.53 
 
 
412 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
188 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  38.55 
 
 
188 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.37 
 
 
421 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
418 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  24.24 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 
406 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
383 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.94 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
404 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
402 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0509  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
389 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.885399  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.31 
 
 
365 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.89 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.86 
 
 
745 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0504  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
391 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
386 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
378 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
374 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
405 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
376 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
458 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  29.9 
 
 
407 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.14 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
371 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.14 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.14 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
370 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
467 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  26.98 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>