More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0700 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  100 
 
 		 407 aa  820    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  98.53 
 
 		 407 aa  810    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  86.45 
 
 		 407 aa  714    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  59.31 
 
 		 405 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  52.45 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  56 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  53.64 
 
 		 409 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  50.12 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  48.67 
 
 		 420 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  52.35 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  49.38 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  49.03 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  47.68 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  48.33 
 
 		 412 aa  360  2e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  47.17 
 
 		 428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  47.33 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  43.45 
 
 		 407 aa  350  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  44.12 
 
 		 406 aa  342  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  45.7 
 
 		 415 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  46.19 
 
 		 411 aa  334  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  47.01 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  43.36 
 
 		 406 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  44.42 
 
 		 432 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  40.83 
 
 		 402 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  44.36 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  47.84 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  42.2 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  46.7 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  45.29 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  40.51 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 423 aa  282  9e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  43.5 
 
 		 460 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  40.57 
 
 		 518 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  43.11 
 
 		 412 aa  272  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  40.35 
 
 		 403 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  41.12 
 
 		 437 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  38 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  42.59 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  37.84 
 
 		 401 aa  245  8e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  33.69 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  27.36 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.03 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  40.78 
 
 		 188 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  40.78 
 
 		 188 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32 
 
 		 402 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  24.31 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  27.17 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 419 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.38 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  23.49 
 
 		 362 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  21.55 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 536 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  36.47 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 375 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  29.59 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 387 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 361 aa  53.1  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 395 aa  53.1  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1499  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 371 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.415023  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 383 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>