More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3858 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 417 aa  858    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  63.7 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  42.38 
 
 		 420 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  41.23 
 
 		 406 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  41.63 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  43.56 
 
 		 443 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  40.34 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  40.15 
 
 		 428 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  39.9 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  41.71 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  38.4 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 		 410 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  38.57 
 
 		 423 aa  282  8.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  40.05 
 
 		 405 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  41.59 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 		 405 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  39.41 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 408 aa  273  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  38.77 
 
 		 407 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  38.64 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  39.32 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  38.11 
 
 		 455 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 		 407 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  38 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  38.12 
 
 		 437 aa  255  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  40.59 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  35.29 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  37.53 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  37.12 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  36.22 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 		 518 aa  209  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 401 aa  206  9e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 412 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  31.12 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  25.94 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  47.73 
 
 		 188 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  48.39 
 
 		 188 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.79 
 
 		 421 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  21.72 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  32.86 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  21.39 
 
 		 384 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.52 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.52 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.52 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.14 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  27.15 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 394 aa  57  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 437 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 405 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 		 378 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3062  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147166  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  22.63 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  21.67 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 904 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07315  glycosyltransferase  20.9 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.160223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  24.62 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>