125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4250 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 388 aa  800    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 381 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  26.2 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  25.32 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  26.11 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  28.95 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.78 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 774 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 		 359 aa  53.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  26.57 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  22 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1236  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 		 765 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.7 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  24.42 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 386 aa  49.7  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 348 aa  49.7  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3848  hypothetical protein  31.58 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  29.17 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  26.67 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  23.33 
 
 		 797 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  24.21 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.76 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 623 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  23.93 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746384 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.17 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 390 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0723451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2192  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 391 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0831  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  23.23 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  23.23 
 
 		 382 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 404 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  26.32 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  27.71 
 
 		 383 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  25.99 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  24.16 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2270  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31835  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  27.98 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 		 789 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0760  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  21.52 
 
 		 759 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 761 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  24.34 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 		 810 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2191  glycogen synthase  23.97 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3146  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.09 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>