More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0760 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0760  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 374 aa  777    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  21.61 
 
 		 1039 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 		 1267 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.8 
 
 		 365 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 		 1267 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  25.41 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  31.16 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1885  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.343299  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  27.62 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  22.13 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4199  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  22.92 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  26.34 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4454  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 386 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.455752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 		 1233 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2575  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 339 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.561026  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 756 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6341  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.93 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0448  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  26.09 
 
 		 448 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.24 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25140  glycosyltransferase  28.69 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06110  glycosyltransferase  27.7 
 
 		 361 aa  53.5  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.224929  normal  0.53478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  29.08 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 375 aa  53.9  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  27.73 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.24 
 
 		 379 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  22.63 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  22.39 
 
 		 427 aa  53.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 658 aa  52.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 409 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 		 404 aa  52.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  26.5 
 
 		 416 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4290  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.19 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.937919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  22.22 
 
 		 351 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  29.81 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  25.48 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4435  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1042  putative glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 2490 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  27.76 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>