More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25140  glycosyltransferase  100 
 
 		 405 aa  835    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11380  glycosyltransferase  54.11 
 
 		 480 aa  223  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.54834  normal  0.650863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  35.96 
 
 		 596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  34.49 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 408 aa  182  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0054  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0374  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.58 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  35.11 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 827 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  31.82 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  29.04 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.76 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  35.04 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.04 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  33.6 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  30.77 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.56 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 689 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.43 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2705  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 803 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.97 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  26.76 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  22.03 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  24.43 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.65 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  22.42 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  28.38 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0356  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.38 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2152  glycogen synthase  25.74 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171657  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  25.33 
 
 		 360 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 		 871 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2341  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  25.69 
 
 		 386 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  28.95 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  32.17 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 568 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  32.17 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 		 351 aa  55.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>