More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0356 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0356  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
395 aa  796    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  28.68 
 
 
401 aa  89.4  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  35 
 
 
434 aa  87.4  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.58 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
439 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  34.36 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.86 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 
411 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
448 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.59 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  34.09 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  37.86 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.93 
 
 
769 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  30.05 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  32.97 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  30.05 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.84 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
425 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
426 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.22 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  33.1 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  23.22 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  34.27 
 
 
435 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  31.94 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
423 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  22.52 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  26.2 
 
 
372 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
468 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 
405 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  31.82 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  32.43 
 
 
480 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
390 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
1261 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  27.35 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  40.2 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.43 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  26.79 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.55 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  29.75 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  31.29 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>