More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0374 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0374  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
428 aa  874    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0054  glycosyl transferase group 1  46.35 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 
412 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  28.15 
 
 
596 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  27.74 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
408 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25140  glycosyltransferase  29.58 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11380  glycosyltransferase  32.74 
 
 
480 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.54834  normal  0.650863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  31.16 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.16 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  24.57 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.62 
 
 
378 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 
370 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  22.35 
 
 
435 aa  67  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  21.77 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  27.33 
 
 
420 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
421 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 
411 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
398 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
393 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  25.9 
 
 
374 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.12 
 
 
350 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
391 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  22.49 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3264  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
377 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  22.71 
 
 
444 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.74 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 
398 aa  60.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
409 aa  60.1  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  18.79 
 
 
382 aa  60.1  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
405 aa  59.7  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 
417 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  22.93 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 
419 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  28.7 
 
 
373 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0793  Glycosyltransferase-like protein  22.89 
 
 
384 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  21.21 
 
 
930 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  20.26 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  22.31 
 
 
480 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  22.33 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  26.42 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  23.48 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  21.04 
 
 
427 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.52 
 
 
388 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
381 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 
373 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1417  starch synthase  21 
 
 
564 aa  57.4  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000275139  hitchhiker  0.0037483 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
385 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  21.78 
 
 
396 aa  57  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
1080 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 
415 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
426 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  21.2 
 
 
400 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
416 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
413 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  20.62 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  20.87 
 
 
421 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
355 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.84 
 
 
410 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
371 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  21.03 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  26.85 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  24.14 
 
 
935 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  25.56 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  29.31 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  20.48 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
383 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  22.29 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  22.31 
 
 
439 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  22.52 
 
 
387 aa  55.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>