More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5882 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
405 aa  789    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  69.81 
 
 
397 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  58.31 
 
 
359 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  58.91 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  55.33 
 
 
357 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  55.06 
 
 
364 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  53.45 
 
 
372 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  48.28 
 
 
666 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  37.04 
 
 
386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
378 aa  189  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 
396 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
395 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
377 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 
379 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  32.44 
 
 
374 aa  117  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  30.67 
 
 
375 aa  116  8.999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
388 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
358 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
381 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
394 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  25.06 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  37.66 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
382 aa  86.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  39.51 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  39.08 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  43.88 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  38.5 
 
 
382 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  42.03 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  36.75 
 
 
750 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  35.55 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  38.46 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  42.48 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  34.13 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  41.61 
 
 
362 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  44.67 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  37.89 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  42.11 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  41.03 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  40.28 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  38.02 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
378 aa  69.7  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  45.03 
 
 
344 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  30.95 
 
 
425 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
396 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  42.34 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  40.38 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
425 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  35.8 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.49 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  40.4 
 
 
739 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 
424 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  39.35 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  38.27 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
450 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  34.05 
 
 
407 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
448 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
376 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
439 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
379 aa  64.3  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  39.74 
 
 
439 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
399 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3101  glycosyltransferase  37.76 
 
 
392 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325178  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  39.74 
 
 
439 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0086  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 
442 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  40.29 
 
 
371 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
425 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  32.19 
 
 
423 aa  63.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 
360 aa  63.2  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>