More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2282 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 381 aa  759    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  50.53 
 
 		 382 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  50.68 
 
 		 358 aa  336  5e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  48.04 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  47.48 
 
 		 381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  43.46 
 
 		 379 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  46.84 
 
 		 374 aa  289  6e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 		 395 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  37.16 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 374 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 386 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 		 372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  33.24 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  32.97 
 
 		 357 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  34.07 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  25.5 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 		 666 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 397 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 388 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  38.41 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  39.6 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0955  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  26.44 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  22.94 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  28 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5854  putative glycosyl transferase  28.19 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 394 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  34.9 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  35.21 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  29.32 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 422 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  25.48 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0360  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 405 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  20.27 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  29.71 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.12 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  27.75 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0793  Glycosyltransferase-like protein  24.22 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  30.47 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  28.37 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.66 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  27.22 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>