More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1118 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  100 
 
 		 425 aa  871    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  98.82 
 
 		 425 aa  860    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  51.56 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  49.16 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  41.91 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3216  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 		 414 aa  299  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.573386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  39.05 
 
 		 418 aa  272  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 		 419 aa  256  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  35.97 
 
 		 413 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  35.97 
 
 		 413 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 441 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  24.95 
 
 		 778 aa  133  6e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 782 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2588  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  29.97 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 539 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 452 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 733 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 445 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  27 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  26.2 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3815  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.2599  normal  0.775775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3802  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 466 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 		 397 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 445 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.48 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  28.35 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 392 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0719  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  27.8 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.99 
 
 		 398 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0472  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465878  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4490  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  29.63 
 
 		 364 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  24.57 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 		 353 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5389  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 1265 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.604421  normal  0.386182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5004  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000372843 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5722  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 		 1271 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702468  hitchhiker  0.00500958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6389  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.447732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  24.1 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 924 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 1303 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2183  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0575473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  32.45 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 753 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  31.21 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5582  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 1239 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2501  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.94 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 402 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  26.7 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  33.73 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>