More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3116 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 377 aa  776    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  36.56 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  35.9 
 
 		 378 aa  238  9e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  32.88 
 
 		 364 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  31.95 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  31.37 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  33.42 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  33.51 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 381 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  32.42 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  31.59 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 397 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  32.29 
 
 		 384 aa  149  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 666 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 364 aa  95.9  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 		 382 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  30.9 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 401 aa  69.3  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 422 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1188  glycosyl transferase, group 1  24.48 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  26.56 
 
 		 450 aa  67  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 482 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.74 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4124  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  25.57 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0821  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.534399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.15 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  29.6 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  28.04 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  31.76 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0782  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  25.53 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  25.56 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2186  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.26 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.7 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.79 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3679  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.46 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  27.7 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  26.67 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.26 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  26.43 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4450  GumI protein  25 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>