205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0683 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
482 aa  965    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  80.42 
 
 
480 aa  738    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  60.38 
 
 
469 aa  511  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  47.25 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 
1243 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
1089 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
1398 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3844  hypothetical protein  28.94 
 
 
427 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.429225 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
1261 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
1028 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
1915 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3296  WcbH  28.39 
 
 
598 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3247  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 
598 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3282  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 
598 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.741817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2300  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 
598 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0528  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 
598 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.81282  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1071  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 
598 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108394  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2178  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 
598 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
1229 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
1241 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
1241 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  30.98 
 
 
787 aa  127  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3987  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
519 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181654  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  26.52 
 
 
743 aa  95.5  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
609 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
1332 aa  74.3  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0290  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
423 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0191  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
779 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  32.61 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
398 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0135  hypothetical protein  23.68 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  32.04 
 
 
375 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.89 
 
 
404 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  27.64 
 
 
419 aa  60.1  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
395 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
412 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
780 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
761 aa  57.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
410 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
424 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0740  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 
823 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
439 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
439 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
426 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
396 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  29.63 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.94 
 
 
394 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  28.1 
 
 
348 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
439 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
415 aa  53.5  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
419 aa  53.5  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
386 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
373 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3114  glycosyl transferase, group 1  26.71 
 
 
391 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
393 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 
422 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
425 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
426 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
393 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
380 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
395 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.15 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
357 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
397 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
409 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
411 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1450  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
411 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.925912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
413 aa  51.2  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
358 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
392 aa  50.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 
382 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
434 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
396 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3376  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
399 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000624508  hitchhiker  0.000924483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.26 
 
 
367 aa  50.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5602  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
399 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115159  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
440 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
398 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 
396 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4492  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
399 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0132524  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  24.35 
 
 
386 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
392 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
377 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
378 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 
473 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 
473 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  32.84 
 
 
374 aa  50.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5324  glycosyltransferase  25.15 
 
 
759 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
517 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  25.3 
 
 
390 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  21.22 
 
 
394 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>