22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0831 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3848  hypothetical protein  92.52 
 
 
401 aa  785    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0831  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
423 aa  880    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2460  glycosyl transferase group 1  62.16 
 
 
419 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1081  hypothetical protein  29.83 
 
 
411 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
379 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6404  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.598711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  35.1 
 
 
395 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
377 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  34.53 
 
 
382 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  27.11 
 
 
770 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
411 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
388 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
382 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.43 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.71 
 
 
650 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
374 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>