25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3848 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3848  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  833    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0831  glycosyl transferase group 1  92.52 
 
 		 423 aa  785    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2460  glycosyl transferase group 1  62.31 
 
 		 419 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1081  hypothetical protein  30.48 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6404  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.598711 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  36.8 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4250  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.142252  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  26.79 
 
 		 770 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 370 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.43 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>