More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_E0061 on replicon NC_009790
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  95.86 
 
 
362 aa  730    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  99.45 
 
 
362 aa  753    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  98.9 
 
 
362 aa  751    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
362 aa  755    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  59 
 
 
367 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4386  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
364 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
377 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
368 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 
371 aa  99.8  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
377 aa  99.4  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 
364 aa  96.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
379 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  22.44 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
394 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
382 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
381 aa  89.7  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.17 
 
 
365 aa  89.4  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
383 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
360 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 
364 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.03 
 
 
420 aa  87  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.66 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  29.94 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
388 aa  82.8  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
389 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  29.6 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1076  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  24.04 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.19 
 
 
769 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.81 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1970  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.622301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1904  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
482 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  36.17 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.08 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  20.56 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  27.36 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0292  glycosyltransferase  23.92 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000491136  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  31.18 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  21.77 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  20.72 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.78 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.47 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  24.07 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  31.52 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.49 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  28.99 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
411 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  27.17 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
403 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  27.17 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>