More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4386 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4386  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
357 aa  733    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  35.53 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4854  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.04 
 
 
362 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.75 
 
 
362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.75 
 
 
362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0261  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.04 
 
 
362 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
371 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.27 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
377 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
396 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
396 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
364 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  27.19 
 
 
395 aa  85.9  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
399 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
414 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  22.75 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.04 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.88 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
432 aa  72.8  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.93 
 
 
365 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.59 
 
 
419 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
381 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.86 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
410 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 
367 aa  70.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.54 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.56 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
377 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  29.8 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  26.07 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
396 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  23.16 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.61 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.47 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
353 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
405 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
536 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.37 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  21.35 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  34.71 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 
366 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
748 aa  66.2  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.67 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  25.6 
 
 
342 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
415 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  31.43 
 
 
360 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
406 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  29.03 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>