43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2676 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2676  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 569 aa  1135    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2744  glycosyl transferase, group 1  75.65 
 
 		 568 aa  830    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0287035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2758  glycosyl transferase, group 1  46.75 
 
 		 627 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  41.46 
 
 		 822 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  38.88 
 
 		 841 aa  290  7e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  41.12 
 
 		 838 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  38.29 
 
 		 841 aa  283  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  40.15 
 
 		 836 aa  280  4e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0418  hypothetical protein  36.29 
 
 		 462 aa  261  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.510346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16210  hypothetical protein  24.9 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 790 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 377 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.4 
 
 		 394 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 415 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 384 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 		 378 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1640  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 384 aa  50.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30 
 
 		 396 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 		 385 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 517 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 767 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4496  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 374 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 386 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1620  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 380 aa  47.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 370 aa  47  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 		 789 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1689  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 		 381 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 385 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 774 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0925  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 761 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.259199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  40.3 
 
 		 370 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 763 aa  45.8  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  39.02 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  21.81 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 343 aa  45.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 390 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 390 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  40.54 
 
 		 422 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 		 372 aa  43.9  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 463 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>