25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2744 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2676  glycosyl transferase, group 1  75.65 
 
 
569 aa  828    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2744  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
568 aa  1129    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0287035  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2758  glycosyl transferase, group 1  47.76 
 
 
627 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  41.01 
 
 
822 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  41.12 
 
 
838 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  38.99 
 
 
841 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0418  hypothetical protein  37.63 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.510346  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  39.85 
 
 
836 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 
841 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16210  hypothetical protein  23.57 
 
 
304 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
342 aa  54.7  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1162  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
790 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
385 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.7 
 
 
396 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
385 aa  51.6  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
415 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
386 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
364 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
372 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1620  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 
380 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
364 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
393 aa  45.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
774 aa  45.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  39.76 
 
 
402 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
370 aa  43.5  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>