52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0418 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0418  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  922    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.510346  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  54.11 
 
 
836 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  46.24 
 
 
841 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  47.91 
 
 
838 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  46.32 
 
 
822 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  42 
 
 
841 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2744  glycosyl transferase, group 1  37.63 
 
 
568 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0287035  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2676  glycosyl transferase, group 1  34.97 
 
 
569 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2758  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 
627 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16210  hypothetical protein  25.69 
 
 
304 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
412 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
412 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
410 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  21.76 
 
 
373 aa  53.9  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 
859 aa  53.5  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
774 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
377 aa  50.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
436 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  35.87 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  24.88 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
763 aa  47  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.38 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
395 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
360 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 
353 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
385 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1916  glycosyltransferase  21.82 
 
 
390 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  28.19 
 
 
861 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3427  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
435 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000419175  normal  0.0303582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 
396 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 
415 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
414 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
545 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
414 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1920  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
481 aa  43.9  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
516 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
535 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  28.69 
 
 
399 aa  43.5  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
445 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
373 aa  43.5  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>