85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0666 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  823    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  30.56 
 
 
404 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0061  glycosyltransferase  29.45 
 
 
411 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.715924  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  25.15 
 
 
420 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30010  hypothetical protein  22.82 
 
 
416 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1931  hypothetical protein  24.29 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  21.79 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
406 aa  63.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
360 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1113  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
400 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0337008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  20.75 
 
 
405 aa  56.6  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
405 aa  56.6  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  23.16 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  22.04 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  20.91 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  20.85 
 
 
416 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 
405 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 
408 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
768 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  34.41 
 
 
2401 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0667  glycosyl transferase, group 1  24.58 
 
 
360 aa  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  22.3 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  20.87 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
441 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
416 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.68 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  30.68 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 
415 aa  50.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  30.68 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  22.42 
 
 
402 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.68 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  30.68 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.68 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2460  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
353 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  23.62 
 
 
388 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  29.94 
 
 
396 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  22 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  31.4 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  20.94 
 
 
364 aa  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  22.09 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
400 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.73 
 
 
409 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 
373 aa  47  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0026  Glycosyltransferase-like protein  22.57 
 
 
454 aa  46.6  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
373 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  22.03 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
349 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
374 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  19.17 
 
 
359 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  21.52 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0925  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.41 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
370 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 
359 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1042  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
339 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
358 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  23.37 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
380 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  19.57 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
395 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.82 
 
 
394 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0418  hypothetical protein  28.69 
 
 
462 aa  43.5  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.510346  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00694  hypothetical protein  23.31 
 
 
312 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  19.5 
 
 
407 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0334  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
411 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.145244 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
391 aa  43.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4512  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
375 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
404 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>