More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0911 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  776    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  81.67 
 
 
373 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  83.19 
 
 
365 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  72.43 
 
 
376 aa  530  1e-149  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  65.62 
 
 
362 aa  483  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  59.94 
 
 
362 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  49.71 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.28 
 
 
354 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.28 
 
 
354 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.28 
 
 
400 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
354 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  49 
 
 
354 aa  332  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  50 
 
 
354 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.71 
 
 
354 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.71 
 
 
354 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.71 
 
 
354 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.71 
 
 
354 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  48.28 
 
 
354 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  48.28 
 
 
354 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  48.28 
 
 
354 aa  325  5e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  48.42 
 
 
372 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  49.27 
 
 
354 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  47.54 
 
 
355 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  47.95 
 
 
355 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  48.13 
 
 
408 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  48.54 
 
 
365 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  47.84 
 
 
355 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  47.99 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  47.99 
 
 
354 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  46.31 
 
 
359 aa  319  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  49.27 
 
 
361 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  47.97 
 
 
356 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  47.26 
 
 
349 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  47.38 
 
 
354 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1626  glycosyl transferase group 1  50.73 
 
 
377 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.726366  decreased coverage  0.00120235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1908  glycosyl transferase group 1  50.73 
 
 
377 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  48.67 
 
 
349 aa  315  6e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  46.63 
 
 
364 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  47.38 
 
 
354 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1033  glycosyl transferase, group 1  48.13 
 
 
355 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  46.38 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  47.38 
 
 
354 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  49.85 
 
 
377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  47.38 
 
 
354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  47.38 
 
 
354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  47.38 
 
 
354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  47.38 
 
 
354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.8 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.8 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.8 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.8 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.8 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.8 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1948  glycosyl transferase group 1  45.09 
 
 
355 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.346715 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  47.95 
 
 
365 aa  312  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.8 
 
 
354 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.8 
 
 
354 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  46.8 
 
 
354 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.8 
 
 
354 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2311  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.8 
 
 
354 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2433  glycosyl transferase group 1 protein  44.8 
 
 
354 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2271  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.8 
 
 
354 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3396  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.8 
 
 
354 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90487  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  46.76 
 
 
370 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.8 
 
 
354 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.8 
 
 
354 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  46.51 
 
 
354 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  48.28 
 
 
376 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  44.51 
 
 
355 aa  310  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1050  glycosyl transferase group 1  44.22 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  48.28 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  46.51 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17290  UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase  45.88 
 
 
360 aa  306  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  46.2 
 
 
354 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  46.22 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  45.85 
 
 
374 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1795  glycosyl transferase group 1  43.93 
 
 
354 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  43.99 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  45.92 
 
 
354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  43.06 
 
 
354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  43.06 
 
 
354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  43.35 
 
 
417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 
354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 
364 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3151  glycosyl transferase group 1  48.7 
 
 
376 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  46.04 
 
 
363 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  47.08 
 
 
363 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  46.8 
 
 
359 aa  296  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  45.77 
 
 
355 aa  295  9e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0487  glycosyl transferase, group 1  43.24 
 
 
355 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  45.17 
 
 
357 aa  289  7e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  43.64 
 
 
354 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  43.63 
 
 
339 aa  280  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  42.28 
 
 
367 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  41.86 
 
 
374 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  39.47 
 
 
360 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0844  putative glycosyltransferase  48.06 
 
 
310 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0684167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  41.03 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1042  glycosyl transferase group 1  37.94 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>