More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20190 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  100 
 
 
340 aa  695    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0140  glycosyl transferase, group 1  54.73 
 
 
377 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  54.76 
 
 
364 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  53.12 
 
 
368 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  53.12 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4060  glycosyl transferase group 1  44.81 
 
 
368 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.586915  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3683  glycosyl transferase, group 1  44.51 
 
 
402 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  41.35 
 
 
386 aa  241  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  39.48 
 
 
359 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  38.08 
 
 
353 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  40.11 
 
 
365 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0258  glycosyl transferase, group 1  41.18 
 
 
351 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  39.08 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0705  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
353 aa  223  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  38.26 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
367 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 
373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
362 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  37.68 
 
 
354 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  38.11 
 
 
362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  39.03 
 
 
360 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  36.89 
 
 
365 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
349 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  37.46 
 
 
357 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.86 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 
354 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  38.95 
 
 
354 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  38.95 
 
 
354 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  38.95 
 
 
354 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 
355 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  38.95 
 
 
354 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.86 
 
 
354 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.86 
 
 
354 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.86 
 
 
400 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  38.08 
 
 
354 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 
354 aa  205  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  37.21 
 
 
354 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.29 
 
 
354 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.29 
 
 
354 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  38.08 
 
 
349 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.29 
 
 
354 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 
354 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 
372 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.29 
 
 
354 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1230  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 
374 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.377048  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
354 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3260  glycosyl transferase, group 1  34.02 
 
 
364 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  37.18 
 
 
363 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  37.79 
 
 
354 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
354 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 
374 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
354 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
354 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
354 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.99 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  37.79 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 
370 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  37.06 
 
 
355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  34.71 
 
 
458 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.81 
 
 
354 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  36.66 
 
 
364 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.52 
 
 
354 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.52 
 
 
354 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.52 
 
 
354 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.52 
 
 
354 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.52 
 
 
354 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.52 
 
 
354 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  36.81 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
355 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  37.61 
 
 
364 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  37.39 
 
 
363 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  37.03 
 
 
344 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  36.81 
 
 
356 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  38.26 
 
 
365 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  37.43 
 
 
366 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  37.75 
 
 
354 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
343 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1033  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
355 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4020  glycosyl transferase group 1  38.99 
 
 
339 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  35.28 
 
 
417 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 
379 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  36.71 
 
 
376 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  34.99 
 
 
354 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 
361 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0142  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
346 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224106  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2085  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 
346 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.057085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2162  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.57 
 
 
354 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  37.86 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2254  sugar transferase, glycosyltransferase, group 1  34.99 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.130773  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  35.17 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1823  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0794741  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1417  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.28 
 
 
354 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1181  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.28 
 
 
354 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.584348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.28 
 
 
354 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.574417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>