More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3683 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4060  glycosyl transferase group 1  88.32 
 
 
368 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.586915  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3683  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
402 aa  796    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0140  glycosyl transferase, group 1  50.58 
 
 
377 aa  323  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2855  group 1 glycosyl transferase  47.89 
 
 
364 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8126  glycosyl transferase group 1  47.66 
 
 
368 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20190  glycosyltransferase  44.51 
 
 
340 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442507  normal  0.152951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2978  putative glycosyltransferase  42.47 
 
 
360 aa  261  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2561  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 
355 aa  222  9e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2674  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
367 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.875831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4593  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
363 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3069  group 1 glycosyl transferase  34.83 
 
 
357 aa  206  5e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5057  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0361  glycosyl transferase group 1  37.01 
 
 
386 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0161  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
365 aa  195  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0705  glycosyl transferase group 1  36.57 
 
 
353 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3461  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 
353 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1263  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.26 
 
 
376 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0911  glycosyl transferase group 1  35.63 
 
 
373 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000886615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1204  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
362 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00332154  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0235  glycosyl transferase group 1  35.86 
 
 
365 aa  189  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000857963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1356  glycosyl transferase, group 1  34.94 
 
 
373 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000136781  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0920  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
362 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.492126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1042  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
339 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1281  putative glycosyl transferase  36.31 
 
 
360 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93483  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 
374 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0258  glycosyl transferase, group 1  37.98 
 
 
351 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3209  glycosyl transferase, group 1  36.06 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2712  glycosyl transferase group 1  35.28 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0416  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552553  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1363  glycosyl transferase, group 1  35.55 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0232549  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5851  glycosyl transferase group 1  34.58 
 
 
364 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0862  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
355 aa  170  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1900  hypothetical protein  30.34 
 
 
351 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2613  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 
343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3352  glycosyl transferase, group 1  35.46 
 
 
354 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.41509 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3151  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
376 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0159  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
372 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.999055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0176  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
354 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0163  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 
354 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.628752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17290  UDP-Glycosyltransferase/glycogen phosphorylase  35.83 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0326  glycosyl transferase, group 1  35.08 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2980  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172457  hitchhiker  0.000000269533 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1141  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0760697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0506  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.769782  normal  0.0165871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0861  glycosyl transferase group 1  34.45 
 
 
354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1610  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.0108296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5322  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
376 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1033  glycosyl transferase, group 1  35.67 
 
 
355 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2857  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
354 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135922  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3692  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0232  glycosyl transferase group 1  34.9 
 
 
354 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0250  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 
354 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0702  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 
359 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0487  glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
355 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3861  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.8 
 
 
354 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0083  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.43 
 
 
400 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3140  mannose-6-phosphate isomerase, bifunctional enzyme  32.85 
 
 
458 aa  161  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.116688  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2321  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
408 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223153 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3942  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.43 
 
 
354 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946253  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4272  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 
354 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211341  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3188  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.61 
 
 
354 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565728  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0336  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
400 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2866  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.23 
 
 
354 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1136  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
354 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3110  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.23 
 
 
354 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3441  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.23 
 
 
354 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1678  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.23 
 
 
354 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0681  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 
354 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1160  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 
354 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1042  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
354 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3821  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
354 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00699792  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3260  glycosyl transferase, group 1  33.9 
 
 
364 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1038  glycosyl transferase, group 1  34.75 
 
 
354 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0691  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
366 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2112  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
365 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1626  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
377 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.726366  decreased coverage  0.00120235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1245  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 
354 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4899  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
363 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2145  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 
354 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1908  glycosyl transferase group 1  32.85 
 
 
377 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.446815 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2811  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.8 
 
 
354 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1760  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.8 
 
 
354 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0568  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.8 
 
 
354 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5555  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
379 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2751  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.8 
 
 
354 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285751  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2842  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.8 
 
 
354 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2438  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.8 
 
 
354 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.181607  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1554  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
349 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0113  putative glycosyltransferase  33.71 
 
 
354 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328541  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5197  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
364 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683568  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2870  glycosyl transferase group 1 protein  34.08 
 
 
354 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2878  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
354 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0243297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1780  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
354 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0979893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5160  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
336 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1757  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.52 
 
 
354 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.748949  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
354 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1886  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
354 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5186  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
417 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2781  putative glycosyl transferase  33.99 
 
 
356 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692586  normal  0.55276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1909  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
354 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>