109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2460 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2460  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
353 aa  732    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
410 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
517 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  25.9 
 
 
1302 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  28.75 
 
 
396 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 
391 aa  56.6  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
403 aa  56.6  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
396 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  21.45 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.15 
 
 
383 aa  53.5  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
367 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
374 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  23.92 
 
 
417 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  20.2 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  22.35 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.15 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  21.49 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  25.23 
 
 
399 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 
816 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
405 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0297  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.62 
 
 
355 aa  49.7  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 
416 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 
393 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
372 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
405 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 
374 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
409 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
434 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  20.52 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
407 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
369 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  21.93 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  22.67 
 
 
430 aa  47.4  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.67 
 
 
427 aa  47  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.84 
 
 
373 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
373 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  20.39 
 
 
422 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 
358 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  20.54 
 
 
396 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3170  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  23.63 
 
 
428 aa  46.2  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
382 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
404 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
381 aa  46.2  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 
406 aa  46.2  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
903 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0352  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
404 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  25.28 
 
 
419 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4100  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0825804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  21.76 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0710  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.28 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
420 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  26.62 
 
 
412 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  22.12 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  21.98 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
374 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
406 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.16 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
378 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  25.95 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  22.81 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
409 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  20.17 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3774  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  20 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  20.07 
 
 
453 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
392 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
374 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35680  hypothetical protein  26.73 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000110612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
367 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  19.93 
 
 
423 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
404 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
364 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
437 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
403 aa  43.5  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>