More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3774 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3774  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
372 aa  770    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1037  putative glycosyltransferase group 1 family protein  73.55 
 
 
380 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201678  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3532  glycosyl transferase group 1  67.13 
 
 
389 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4558  glycosyl transferase group 1  64.5 
 
 
381 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478096  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0859  glycosyl transferase group 1  64.8 
 
 
384 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984079  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2594  glycosyl transferase, group 1  53.41 
 
 
399 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0321424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0479  putative glycosyltransferase  58.26 
 
 
366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3401  glycosyl transferase group 1  53.51 
 
 
414 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.135744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3129  glycosyl transferase group 1  53.93 
 
 
414 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2025  glycosyltransferase  53.01 
 
 
361 aa  394  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.872693  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2700  glycosyl transferase, group 1  50.53 
 
 
414 aa  381  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2278  glycosyl transferase, group 1  48.28 
 
 
369 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0724331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0926  glycosyl transferase group 1  45.68 
 
 
364 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.79 
 
 
820 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.79 
 
 
856 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.79 
 
 
820 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4045  glycosyl transferase, group 1  46.39 
 
 
360 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  46.79 
 
 
820 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  46.79 
 
 
820 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  46.79 
 
 
820 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.79 
 
 
856 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4009  glycosyl transferase group 1  44.75 
 
 
361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1701  glycosyl transferase, group 1  41.39 
 
 
363 aa  308  8e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0309421  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.15 
 
 
857 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4215  glycosyl transferase group 1  44.51 
 
 
374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1177  glycosyl transferase group 1  44.11 
 
 
382 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  44.83 
 
 
821 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6748  glycosyl transferase group 1  44.15 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2536  putative first mannosyl transferase,o- antigen biosynthesis  46.93 
 
 
407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1357  glycosyl transferase, group 1  43.49 
 
 
383 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.765434  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  44.68 
 
 
821 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1124  glycosyl transferase group 1  45.81 
 
 
402 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483149  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  44.21 
 
 
820 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  45.43 
 
 
819 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  45.09 
 
 
821 aa  301  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  45.43 
 
 
822 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3448  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.59 
 
 
409 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  43.34 
 
 
818 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3665  glycosyl transferase group 1  43.65 
 
 
363 aa  299  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1681  glycosyl transferase, group 1  42.05 
 
 
383 aa  299  4e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0524  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.33 
 
 
414 aa  299  5e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  44.83 
 
 
821 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  44.83 
 
 
821 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1810  glycosyl transferase, group 1  43.23 
 
 
416 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1689  glycosyl transferase, group 1  41.45 
 
 
382 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3728  glycosyl transferase group 1  44.05 
 
 
397 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0346462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  42.89 
 
 
828 aa  295  8e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3127  glycosyl transferase, group 1  41.87 
 
 
380 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.020191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0632  glycosyl transferase, group 1  44.12 
 
 
413 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0032  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 
413 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2880  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 
413 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.447923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0810  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 
413 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0314392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2204  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 
413 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.298116  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2502  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 
413 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0300016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0647  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.12 
 
 
413 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0914561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2264  glycosyl transferase, group 1  40.9 
 
 
385 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6735  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  44.56 
 
 
742 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0294  aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
374 aa  287  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0349  glycosyl transferase, group 1  42.06 
 
 
398 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.329915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3230  glycosyl transferase, group 1  42.52 
 
 
409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.577335  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1680  glycosyl transferase group 1  42.74 
 
 
405 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383608  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0496  glycosyl transferase, group 1  39.4 
 
 
371 aa  281  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.166114  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1127  glycosyl transferase group 1  43.87 
 
 
402 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.353198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0733  glycosyl transferase group 1  41.98 
 
 
402 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0519502  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6492  glycosyl transferase, group 1  44.08 
 
 
402 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.737986  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1036  glycosyl transferase, group 1  39.5 
 
 
378 aa  276  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1710  glycosyl transferase group 1  43.24 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.586278  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6093  glycosyl transferase group 1  43.19 
 
 
389 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456986  decreased coverage  0.00115696 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3451  glycosyl transferase group 1  42.15 
 
 
412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.69253  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2690  group 1 glycosyl transferase  38.3 
 
 
378 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.823218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2100  glycosyl transferase, group 1  38.03 
 
 
381 aa  262  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2781  glycosyl transferase group 1  38.18 
 
 
386 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3320  glycosyl transferase group 1  38.18 
 
 
386 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.406315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0274  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 
378 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0182  glycosyl transferase group 1  40.7 
 
 
389 aa  256  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3256  glycosyl transferase, group 1  38.61 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0836  glycosyl transferase group 1  41.19 
 
 
390 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.367499  normal  0.134682 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0884  glycosyltransferase  37.73 
 
 
407 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.287497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17391  glycosyltransferase  38.28 
 
 
407 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0836  glycosyltransferase  37.6 
 
 
409 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.260131  hitchhiker  0.000830652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3393  glycosyl transferase group 1  38.84 
 
 
378 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1115  glycosyl transferase, group 1  35.89 
 
 
362 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.282541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1553  glycosyltransferase  38.68 
 
 
415 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451561  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13661  glycosyltransferase  36.97 
 
 
401 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.244313  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3126  group 1 glycosyl transferase  34.88 
 
 
366 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.154017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0414  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
363 aa  223  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20091  glycosyltransferase  35.03 
 
 
410 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3590  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 
372 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3663  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 
372 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362873  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3595  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 
372 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0979508  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3205  glycosyl transferase, group 1  33.78 
 
 
387 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0019  glycosyl transferase group 1  37.27 
 
 
370 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0112431  normal  0.0520774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1577  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
371 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0548875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0369  mannosyltransferase  29.4 
 
 
365 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2980  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
419 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0963  glycosyl transferase, group 1  39.23 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3076  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
365 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0750  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
361 aa  122  9e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366124  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1064  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.271463  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
359 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>