More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4227 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4227  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 373 aa  761    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0456  glycosyl transferase group 1  79.37 
 
 		 394 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0795  glycosyl transferase group 1  60.92 
 
 		 368 aa  428  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2080  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.937397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2994  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.767293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2687  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.119599  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3343  putative glycosyl transferase  27.67 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8509  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0751  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00694641  hitchhiker  0.000111123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2376  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0997  hypothetical protein  29.07 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2358  Glycosyltransferase-like protein  32.3 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  36.61 
 
 		 803 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  33.79 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1574  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.178155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  29.37 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  42.17 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  35.34 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  20.68 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.58 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  34.96 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  38.16 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  36.96 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  20.85 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0062  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 353 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 820 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  26.57 
 
 		 384 aa  56.6  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 871 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.55 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  39.47 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  39.47 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0054  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.025543  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  22.48 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1001  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  37.37 
 
 		 421 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 		 378 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 401 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4898  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.28 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 346 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0201  glycosyl transferase group 1  22.65 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00670088  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2810  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 827 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  32 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  36.11 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1661  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000116715  hitchhiker  0.00132012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  25.46 
 
 		 401 aa  53.5  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.54 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3658  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 386 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  38.38 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 		 405 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4495  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 380 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0061  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.1 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 424 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 		 816 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0045  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.1 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  33.64 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>