25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1931 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1931  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  852    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0666  hypothetical protein  24.29 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.202618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0061  glycosyltransferase  22.06 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.715924  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  24 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14201  hypothetical protein  24.36 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  22.61 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 383 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4034  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.55 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  23.55 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.55 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 507 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  25.61 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  24.74 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  20.53 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  20.16 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 		 392 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 		 507 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  21.12 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>