61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1087 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1087  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  730    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3949  glycosyl transferase group 1  20.87 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.256853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5928  succinoglycan biosynthesis protein  23.75 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  26.9 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 		 372 aa  53.1  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 507 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2564  glycosyltransferase, succinoglycan biosynthesis protein exoL  25.38 
 
 		 389 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  27.71 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1223  glycosyltransferase, succinoglycan biosynthesis protein ExoL  25 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  27.11 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  23.15 
 
 		 484 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1901  putative glycosyltransferase  29.45 
 
 		 793 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537767  normal  0.403992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3699  hypothetical protein  27.16 
 
 		 238 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 377 aa  49.7  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4940  glycosyl transferase group 1  20.55 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  28.91 
 
 		 557 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0730  capsular polysaccharide biosynthesis protein Cps4F  23.64 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  26.83 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 385 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 405 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4956  putative glucosyltransferase protein  22.09 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0869476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.86 
 
 		 414 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 403 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 414 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1269  colanic acid biosynthesis glycosyl-transferase  23.86 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  22.7 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4806  hypothetical protein  23.44 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 412 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.5 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.29 
 
 		 432 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  23.49 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  23.29 
 
 		 432 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  26.06 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 384 aa  43.1  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 463 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 360 aa  42.7  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>