41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2121 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2121  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  788    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160147  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1307  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 		 357 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7626  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3772  glycosyltransferase  30.12 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4020  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0377  Glycosyltransferase-like protein  26.3 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.855728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2553  hypothetical protein  31.76 
 
 		 479 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0163  group 1 glycosyl transferase  27.24 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.204374 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 441 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.46 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.49 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 		 370 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  22.6 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.34 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0363  putative glycosyltransferase  26.86 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2094  putative glycosyl transferase  30.94 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3373  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0497821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 		 421 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  43.37 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 		 382 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3853  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.208611  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 		 575 aa  43.5  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 415 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>