26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4020 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4020  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
368 aa  759    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1307  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3772  glycosyltransferase  23.81 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.987552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2121  hypothetical protein  24.65 
 
 
398 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.8 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 
411 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
394 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  21.48 
 
 
411 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2941  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3823  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.372091  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  22.73 
 
 
382 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
467 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
415 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
374 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0925  hypothetical protein  25 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.910156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
457 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0922  hypothetical protein  25.6 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  21.52 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  21.74 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3471  glycosyl transferase, group 1  19.75 
 
 
390 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.152793  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  21.39 
 
 
390 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  22.16 
 
 
398 aa  42.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>