41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1495 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1495  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  861    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3346  glycosyltransferase-like protein  30.22 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0061  glycosyltransferase  24.23 
 
 		 411 aa  72.8  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.715924  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 817 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30010  hypothetical protein  27.14 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00694  hypothetical protein  27.12 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  24.82 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3712  hypothetical protein  28.11 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0151792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 		 405 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0698  hypothetical protein  28.47 
 
 		 337 aa  54.3  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.172277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2890  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.036478 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  27.03 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3515  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000186871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1537  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.728307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0624  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.18 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0637  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 383 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0762548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0016  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 380 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0290375  normal  0.0192422 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 396 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  24.5 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3634  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  24.51 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2282  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  24.03 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.15 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4414  glycosyl transferase, group 1  22.07 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.63782  normal  0.431195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1684  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  24.56 
 
 		 723 aa  43.9  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 516 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.72 
 
 		 377 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>