More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3892 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3892  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
393 aa  732    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476766  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08640  glycosyltransferase  50.15 
 
 
364 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08730  glycosyltransferase  45.23 
 
 
407 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510164  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20940  glycosyltransferase  40 
 
 
394 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
418 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
408 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  30.02 
 
 
517 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
412 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
406 aa  100  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  32.96 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
404 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
408 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  24.07 
 
 
407 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
410 aa  90.5  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
405 aa  90.1  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 
423 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  22.71 
 
 
416 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.59 
 
 
420 aa  86.7  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  34.87 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  30.66 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  30.27 
 
 
441 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.8 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
405 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
402 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  32.28 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  28.05 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
406 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08930  glycosyltransferase  32.21 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.04 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.58 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.59 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
810 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2402  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00410607  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25 
 
 
404 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
380 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  24.67 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
360 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
535 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
768 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.44 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  27.53 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  27.53 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  29.95 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3271  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.112636 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  21.07 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  30.39 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2794  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
404 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  27.38 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0791  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 
457 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.714308  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
442 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 
436 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30010  hypothetical protein  31.73 
 
 
416 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.21 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  18.38 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08621  glycosyltransferase-like protein  22.14 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.784838  hitchhiker  0.0000054897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  22.73 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
370 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
770 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  26.97 
 
 
382 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
399 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3791  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  21.65 
 
 
388 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  33.46 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 
458 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>