More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01398 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  100 
 
 		 380 aa  783    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  64.47 
 
 		 380 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  64.47 
 
 		 380 aa  494  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0789  glycosyl transferase group 1  47.3 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  43.68 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6015  GumH protein  44.02 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3789  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3848  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.07 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  22.56 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.13 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  22.59 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.4 
 
 		 935 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  20.86 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.34 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  25.25 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  26.1 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  28.06 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.33 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.33 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.33 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  25.07 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  25.75 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.92 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2094  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.27 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0705287  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.79 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  23.88 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1066  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0173089  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5397  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  26.36 
 
 		 638 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  31.61 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  31.61 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3180  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0473  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4023  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1433  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2623  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  28.76 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  27.53 
 
 		 930 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.56 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 		 375 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6702  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1005  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.105019  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>