More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6015 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6015  GumH protein  100 
 
 		 397 aa  799    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4118  glycosyl transferase group 1  60.1 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3789  glycosyl transferase group 1  59.32 
 
 		 392 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01398  exopolysaccharide xanthan biosynthesis glycosyltransferase GumH  45.53 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1533  GumH protein  42.93 
 
 		 380 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.175349  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1477  glycosyl transferase group 1  42.66 
 
 		 380 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0885553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0789  glycosyl transferase group 1  42.9 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.93 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3848  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 375 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 		 660 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 371 aa  72.8  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  27.67 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.3 
 
 		 935 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  28.19 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 399 aa  69.7  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50490  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol (GPI) biosynthetic protein  25.85 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  22.33 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  29.11 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.75 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 392 aa  66.6  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.4 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  22.82 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00636  hypothetical protein similar to phosphatidylinositol:UDP-GlcNAc transferase PIG-A (Broad)  26.14 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0909226  normal  0.40959 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.65 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 822 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 		 1080 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.07 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  22.2 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  23.93 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1483  methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 885 aa  63.2  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  30.98 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.15 
 
 		 536 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  25.89 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0473  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  26.55 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  22.63 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  27.71 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  26.43 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_006686  CND02330  transferase, putative  27.03 
 
 		 783 aa  60.8  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  22.26 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24.94 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  23.24 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1412  putative glycosyl transferases group 1  29.49 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  34.78 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0770  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  25 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  22.48 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 396 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>